大阪市立自然史博物館は旧自然科学博物館から通算して５０年を越える歴史があります．現在までの歩みをしたにまとめてみました．
博物館と友の会の歴史は、バーチャル特別展「なにわのナチュラリスト」の中の年表でもご覧いただけます。
| 昭和24年 | 11月8日 | 自然科学博物館開設準備委員会設置 |
| 昭和25年 | 4月1日 | 自然科学博物館費予算に計上 |
| 11月10日 | 市立美術館二階廊下において展示開設 | |
| 昭和27年 | 4月17日 | 博物館相当施設に指定 |
| 6月2日 | 大阪市立自然科学博物館条例および規則制定 | |
| 7月10日 | 博物館法第10条により登録（第2号） | |
| 10月1日 | 筒井嘉隆 館長に就任（39.7.4 退任） | |
| 昭和32年 | 6月7日 | 市立美術館より西区靭2丁目（元靭小学校校舎改造）に移転 |
| 昭和33年 | 1月13日 | 開館 |
| 昭和34年 | 新館建設について大阪市社会教育審議会の意見具申 | |
| 昭和39年 | 日本育英会の第一種奨学金の返還を免除される職を置く研究所に指定（文部省） | |
| 8月1日 | 筒井嘉隆 館長に就任（非常勤嘱託-40.7.31退任） | |
| 昭和40年 | 8月1日 | 千地万造 館長に就任（58.6.1退任） |
| 昭和42年 | 大阪市総合計画局“30年後の大阪の将来計画”により長居公園内に新館敷地確定 | |
| 昭和44年 | 8月 | 新館建設のための基本構想審議委員会組織 |
| 昭和45年 | 4月 | 自然史博物館建設委員会組織 |
| 昭和47年 | 1月21日 | 自然史博物館建設工事着工 |
| 昭和48年 | 3月31日 | 自然史博物館建設工事竣工 |
| 4月1日 | 旧館閉館 | |
| 7月 | 新館へ移転開始ならびにディスプレイ契約締結（竣工49年3月） | |
| 昭和49年 | 4月1日 | 大阪市立自然史博物館条例公布 |
| 4月26日 | 自然史博物館開館式挙行 | |
| 4月27日 | 開館 | |
| 昭和51年 | 8月19日 | 文部省科学研究費補助金取扱規定第2条第4号に規定する学術研究機関として指定 |
| 昭和58年 | 7月1日 | 千地万造 館長に就任（非常勤嘱託-61.3.31退任） |
| 昭和59年 | 6月 | 常設展更新基本計画案策定 |
| 昭和60年 | 3月 | 常設展更新計画書策定 |
| 昭和61年 | 3月31日 | 常設展更新業務完成 |
| 4月1日 | 新装開館 | |
| 4月1日 | 小川房人 館長に就任（兼務-2.3.31定年退職） | |
| 4月1日 | 千地万造 顧問に就任（非常勤嘱託-2.3.31退任） | |
| 平成2年 | 4月1日 | 小川房人 館長に就任（非常勤嘱託-3.3.31退任） |
| 平成3年 | 4月1日 | 小川房人 顧問に就任（非常勤嘱託-5.3.31退任） |
| 柴田保彦 館長兼学芸課長に就任（4.3.31定年退職） | ||
| 平成4年 | 4月1日 | 柴田保彦 館長に就任（非常勤嘱託-7.3.31退任） |
| 平成7年 | 4月1日 | 宮武頼夫 館長に就任（9.3.31定年退職） |
| 平成9年 | 4月1日 | 宮武頼夫 館長に就任（非常勤嘱託） |
| 平成9年度 展示更新実施設計および増築にかかる基本・実施設計 | ||
| 平成10年 | 4月1日 | 那須孝悌 館長に就任（13.3.31定年退職） |
| 10月 | （仮称）花と緑と自然の情報センター建築工事着工 | |
| 平成13年 | 4月1日 | 那須孝悌 館長に就任（非常勤嘱託） |
| 4月27日 | 花と緑と自然の情報センター開館 | |
| 平成16年 | 4月27日 | 長居移転(自然史開館)30周年 30周年のメッセージ |
| 11月25日 | 那須孝悌 館長死去 | |
| 平成17年 | 4月1日 | 山西良平 館長に就任 |
| 平成18年 | 3月1日 | ナウマンホールリニューアル |
| 平成18年 | 4月1日 | 財団法人大阪市文化財協会による指定管理に移行 |
| 平成19年-20年 | 第5展示室オープン(第一期オープンは平成19年3月24日、第二期は平成20年4月26日） | |
| 平成22年 | 4月1日 | 財団法人大阪市博物館協会による指定管理に移行 |
| 平成26年 | 4月27日 | 長居移転(自然史開館)40周年 |
| 平成27年 | 4月1日 | 谷田一三 館長に就任 |
| 平成31年 | 4月1日 | 地方独立行政法人 大阪市博物館機構に移行 川端清司 館長に就任 博物館相当施設に移行 |
| 令和6年 | 3月31日 | 登録博物館に復帰 |
| 4月27日 | 長居移転(自然史開館)50周年 | |
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